一、遗传因素
家族中有甲状腺疾病病史的人群，存在遗传易感性，某些特定基因突变可能影响甲状腺细胞的生长调控机制，使个体患甲状腺囊性结节的风险高于普通人群。例如，部分与甲状腺细胞增殖、分化相关的基因发生突变时，甲状腺组织更容易出现异常增生，进而形成囊性结节。
二、碘摄入异常
碘是合成甲状腺激素的关键原料，碘摄入失衡可引发甲状腺囊性结节。长期高碘饮食会干扰甲状腺滤泡上皮细胞的正常代谢，导致细胞异常增生；而碘摄入不足时，甲状腺为维持激素合成，会代偿性增生，也可能促使囊性结节形成。
三、电离辐射暴露
儿童时期颈部接受过电离辐射，如医疗检查中的X射线照射、核事故相关辐射等，会损伤甲状腺细胞的DNA，增加细胞突变概率，从而提高甲状腺囊性结节的发生风险。研究表明，颈部电离辐射暴露史是甲状腺结节发生的重要危险因素之一。
四、内分泌紊乱
女性在青春期、妊娠期、更年期等特殊生理阶段，体内激素水平波动显著。例如，雌激素水平变化可影响甲状腺组织的代谢与生长，使甲状腺滤泡组织易出现异常增殖，进而形成囊性结节。此外，男性内分泌失调时，也可能因激素平衡被打破而增加患病几率。
五、慢性炎症刺激
甲状腺部位的慢性炎症，如自身免疫性甲状腺炎（如桥本甲状腺炎），长期的炎症反应会持续刺激甲状腺滤泡组织，导致组织修复过程中出现囊性变。炎症引起的局部微环境改变，会促使甲状腺细胞发生异常增殖与囊性化改变。
六、生活方式因素
长期精神压力过大、熬夜、缺乏运动等不良生活方式，可影响内分泌系统的平衡，干扰甲状腺激素的正常分泌与调节，间接使甲状腺功能状态失衡，增加甲状腺囊性结节的发生可能性。例如，长期精神紧张会通过神经内分泌途径影响甲状腺的生理功能，导致结节形成风险上升。