眼睛里有凸起的小疙瘩可能是由结膜炎、麦粒肿、结膜结石等造成的。
一、结膜炎：眼睛内的结膜受到细菌等微生物的刺激后，可能会出现乳头样的凸起，从而让人感觉眼睛里有凸起的小疙瘩。结膜是一层覆盖在眼球表面和眼睑内面的透明薄膜，当有细菌等病原体侵袭时，会引发炎症反应，导致结膜充血、水肿，出现乳头、滤泡等增生性改变。
二、麦粒肿：这是由于眼睑处发生细菌感染导致的，其表现为眼睑处有红肿，进而呈现出眼睛里有凸起的小疙瘩的现象。麦粒肿通常是由葡萄球菌感染引起，特别是金黄色葡萄球菌。它会导致眼睑腺体的急性化脓性炎症，形成局限性的红肿硬结。
三、结膜结石：当眼睛内分泌物积存过多时会形成结石，使患者有眼睛里有凸起小疙瘩的感觉。结膜结石主要是由于睑板腺分泌物潴留、变性、钙化等形成的固体物质，一般位于睑结膜面。
此外，霰粒肿、眼肿瘤等疾病也都有可能让患者出现这种感觉眼睛里有凸起的小疙瘩的情况。所以，建议及时前往眼科检查，明确病因，尽早进行处理，以防对视力产生影响。
总之，眼睛里出现凸起小疙瘩的原因较多，需要及时就医检查以明确具体原因，并采取相应的治疗措施。