一、子宫收缩恢复引起
药物流产后，子宫需要通过收缩来恢复至未孕状态，在子宫收缩过程中可能会引起腰部牵涉性疼痛。这是因为子宫与腰部的神经支配有一定关联，子宫收缩产生的刺激会传导至腰部相关神经，从而导致腰疼，这种情况一般随着子宫恢复会逐渐缓解。不同个体对子宫收缩的敏感程度不同，一些体质较弱或子宫复旧相对缓慢的女性可能感觉更明显。
二、盆腔充血未完全消退
药物流产后，盆腔处于充血状态，虽然妊娠组织已排出，但充血状态需要时间消退。盆腔充血会对周围组织包括腰部组织产生一定影响，导致局部组织受压迫或血液循环不畅等情况，进而引发腰疼。年龄较小的女性身体机能相对更易恢复，但如果流产后休息不足等，可能影响盆腔充血消退速度，使腰疼持续时间延长；而年龄较大的女性身体恢复相对缓慢，盆腔充血消退可能更慢，腰疼出现的几率或持续时间可能相对较长。
三、感染因素
如果药物流产后发生宫腔感染等情况，炎症刺激会引起腰疼。感染可能由流产后卫生不良、过早性生活等因素引起。炎症会导致盆腔、腰部周围组织出现炎性反应，表现为腰疼，同时可能伴有发热、阴道分泌物异常等症状。有过流产史或本身有妇科炎症病史的女性，药物流产后发生感染导致腰疼的风险相对较高。
四、姿势不当与劳累
药物流产后女性往往需要休息，但如果休息时姿势不当，长时间保持弯腰、久坐等不良姿势，或者过早进行重体力劳动等，都会加重腰部肌肉劳损，引起腰疼。比如一些女性流产后过早抱孩子、提重物等，会增加腰部肌肉负担，导致腰疼。不同生活方式的女性，如本身从事体力劳动的女性，流产后若不注意休息调整，更易因劳累出现腰疼；而生活方式较sedentary（久坐不动）的女性，突然改变姿势等也可能引发腰部不适。
五、心理因素影响
部分女性在药物流产后可能存在焦虑、紧张等心理状态，这种心理因素也可能影响身体对疼痛的感知，使腰部感觉更易出现疼痛不适。心理压力较大的女性，身体的神经内分泌调节可能发生变化，从而加重腰部疼痛的主观感受。