头皮毛囊炎的治疗方法需根据病情轻重来定。一般来说，轻度头皮毛囊炎可以通过日常护理等方式改善，而中重度可能需要药物治疗。
局部外用药物治疗
抗生素类药膏：如果是细菌感染引起的头皮毛囊炎，常用莫匹罗星软膏，它能抑制细菌生长，起到杀菌消炎的作用。还有夫西地酸乳膏，对多种细菌有抑制效果，可用于治疗头皮的细菌性毛囊炎。抗真菌类药膏：要是由真菌感染导致的头皮毛囊炎，像酮康唑乳膏就比较适用，它能抑制真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用。还有特比萘芬乳膏，也可针对真菌感染的头皮毛囊炎进行治疗。
系统药物治疗
细菌感染严重时：如果头皮毛囊炎情况较为严重，细菌感染扩散，可能需要口服抗生素，比如头孢类抗生素。不过使用前需要确认患者没有头孢类药物过敏史等情况。真菌感染顽固时：对于真菌感染顽固的情况，可能会口服抗真菌药物，像伊曲康唑，但使用这类药物时需要注意监测肝功能等指标。
日常护理要点
保持头皮清洁：要勤洗头，建议每周洗头2 - 3次，选择温和的洗发水，避免刺激头皮。例如使用含有煤焦油成分的洗发水，有助于清洁头皮且对毛囊炎有一定辅助改善作用。避免刺激头皮：不要用力搔抓头皮，也不要频繁染发、烫发，因为这些行为可能会损伤头皮，加重毛囊炎的症状。同时，要注意饮食清淡，少吃辛辣、油腻、甜食等刺激性食物，这些食物可能会加重皮脂腺分泌，不利于头皮毛囊炎的恢复。