卵巢黄体囊肿的形成与多种因素相关。正常情况下，卵巢排卵后会形成黄体，若黄体腔内有大量积液，使腔的直径超过2~3cm，就可能形成黄体囊肿。另外，垂体分泌的促黄体生成素（LH）过度刺激，会让黄体过度黄素化，也易促使黄体囊肿形成。还有，女性内分泌紊乱时，黄体期子宫内膜过度增厚，也可能影响黄体正常退化，进而引发黄体囊肿。
内分泌因素导致
促黄体生成素异常：当体内促黄体生成素分泌出现紊乱时，会影响卵巢黄体的正常发育。比如一些患有内分泌疾病的女性，其体内促黄体生成素水平波动较大，就容易使黄体过度黄素化，增加黄体囊肿形成的风险。一般来说，这种内分泌紊乱可能持续较长时间，若不及时调整，黄体囊肿发生的几率会相对较高。雌激素水平影响：雌激素对卵巢的正常生理功能有重要调节作用。如果雌激素水平异常，会干扰黄体的正常代谢过程。例如在月经周期中，雌激素分泌出现异常波动，就可能导致黄体腔内液体吸收障碍，使得液体积聚形成囊肿。有研究发现，在月经周期某些阶段雌激素水平过高的女性，黄体囊肿的发生率比雌激素水平稳定的女性要高约20%。
排卵相关因素引发
排卵后正常变化异常：女性排卵后，卵泡壁会塌陷形成黄体。正常情况下，黄体会逐渐退化。但如果排卵后，黄体腔内积液过多，且吸收不及时，就会使黄体囊肿形成。通常在排卵后的几天内，如果黄体腔内积液持续增加，直径超过3cm，就可能被诊断为黄体囊肿。一些女性在排卵后身体对积液的吸收机制出现问题，就容易出现这种情况。多次排卵刺激：经常有排卵情况的女性，比如育龄期有正常月经周期且排卵规律的女性，相对来说黄体囊肿形成的几率会稍高。因为多次排卵会使卵巢反复经历黄体形成和退化的过程，增加了黄体出现异常变化形成囊肿的可能性。据统计，育龄女性中约有5% - 10%可能会出现黄体囊肿，其中部分就是因为多次排卵刺激导致的。
其他潜在因素影响
药物作用：某些药物可能会影响卵巢的正常功能，进而诱发黄体囊肿。比如长期使用促排卵药物的女性，由于药物促使卵巢多个卵泡发育和排卵，会干扰黄体的正常状态，增加黄体囊肿形成的风险。这类女性需要在医生的严密监测下使用促排卵药物，以降低黄体囊肿发生的可能性。疾病影响：一些妇科疾病也可能与黄体囊肿的形成有关。例如子宫内膜异位症患者，其体内的异常免疫反应等因素可能会波及卵巢，影响黄体的正常发育，从而增加黄体囊肿的发生几率。患有子宫内膜异位症的女性中，黄体囊肿的发生率比健康女性要高不少，大约能高出2 - 3倍。