急性肠胃炎可以使用的药物有止泻药、解痉药、微生态调节剂等。一般来说，常用的止泻药如蒙脱石散，能在6-12小时左右发挥作用，帮助改善腹泻症状。
止泻药物选择
蒙脱石散：这是常用的止泻药，它可以吸附肠道内的病菌和毒素，在肠道表面形成保护屏障，一般服用后1小时左右开始起效，能帮助改善急性肠胃炎引起的腹泻症状。黄连素片：也有一定的止泻作用，对肠道细菌有抑制作用，可用于细菌感染引起的急性肠胃炎腹泻情况，但儿童使用需谨慎，要在医生指导下根据体重等情况用药。
解痉止痛药物
颠茄片：能缓解胃肠道痉挛，减轻腹痛症状。不过，青光眼患者禁用颠茄片，因为它可能会加重青光眼病情。山莨菪碱片：同样可以解除胃肠道平滑肌痉挛，缓解腹痛，但前列腺肥大患者要慎用，可能会引起排尿困难等问题。
微生态调节剂
双歧杆菌四联活菌片：可以调节肠道菌群，改善肠道微生态环境，有助于急性肠胃炎后肠道功能的恢复。它一般需要冷藏保存，服用时要用温水送服，避免温度过高破坏活菌。枯草杆菌二联活菌颗粒：也能调节肠道菌群，对因肠道菌群失调引起的急性肠胃炎有一定的辅助治疗作用，儿童也可以使用，但要注意按照儿童的剂量来服用。
抗感染药物使用
如果是细菌感染引起的急性肠胃炎，可能会用到抗生素，如诺氟沙星胶囊，但18岁以下的未成年人禁止使用诺氟沙星，因为会影响软骨发育。如果是病毒感染引起的急性肠胃炎，一般不需要使用抗感染药物，主要是对症支持治疗。