射精后阴茎疼痛往往是由前列腺炎、附睾炎导致的，而针对不同病症需采取不同的治疗方法。
一、前列腺炎：
这是一种主要表现为尿道刺激症状与慢性盆腔疼痛的前列腺疾病。若不及时医治，会引发尿频、尿急、直肠刺激症状，甚至出现急性尿潴留。进行前列腺液培养并发现致病病原体，是选用抗菌药治疗的依据，常首选喹诺酮类、四环素类药物。如果患者疼痛显著，可使用塞来昔布、乐松等药物来止痛，同时还可选用前列安通胶囊等中成药以减轻前列腺充血水肿。
二、附睾炎：
附睾炎是由于病原体进入输精管后逆行侵入附睾而引起的炎症。若不及时处理，可能导致阴囊隐痛，出现胀坠感，这种疼痛通常会波及下腹部和腹股沟，也可能伴随继发性鞘膜积液。
1.若疼痛剧烈可先应用止痛药物，接着依据致病菌选择敏感抗菌药物，常用的有喹诺酮类、四环素类药物等，不过需注意严格遵循医嘱用药。
2.患者日常可卧床休息，可使用阴囊托或自制软垫来支撑阴囊。
总之，当患者身体出现不适时应立刻就医。