药流后多数女性仍可正常怀孕，但有一定概率影响以后受孕。有研究显示，药物流产后继发不孕的发生率约在5%~10%左右。
药流对子宫的影响
子宫内膜损伤风险： 药物流产是通过药物使子宫收缩排出孕囊，这个过程可能会对子宫内膜造成一定损伤。如果子宫内膜损伤严重，可能影响受精卵着床，从而影响以后怀孕。一般来说，药流后子宫内膜需要一定时间修复，正常情况下1个月左右可基本恢复，但如果出现感染等情况，修复时间可能延长，增加对怀孕的影响几率。宫腔粘连可能： 药流后如果发生宫腔粘连，会阻碍受精卵着床。宫腔粘连的发生与药流后子宫内膜受损程度、是否发生感染等有关。有数据表明，药流后发生宫腔粘连的概率约为1%~2%，但一旦发生，对怀孕的影响较大。
药流后感染风险及对怀孕的影响
盆腔感染隐患： 药流后如果护理不当，容易发生盆腔感染。盆腔感染可能导致输卵管炎症，使输卵管粘连、堵塞，影响精子和卵子结合以及受精卵运输到子宫着床。有统计显示，药流后发生盆腔感染的概率约为3%~5%，一旦发生盆腔感染，对怀孕的影响较为明显，可能导致不孕或宫外孕等情况。炎症对生殖系统的长期影响： 即使盆腔感染得到控制，炎症造成的生殖系统损伤可能是长期的。例如输卵管炎症可能导致输卵管通而不畅，这种情况下怀孕容易发生宫外孕，而宫外孕对女性健康危害较大，严重时可能危及生命。
药流后内分泌及排卵影响
内分泌短暂紊乱： 药流会引起体内激素水平的波动，导致内分泌短暂紊乱。一般来说，药流后激素水平恢复正常需要1~2个月。如果内分泌紊乱时间过长或恢复不佳，可能影响排卵功能。有研究发现，约有10%左右的女性药流后会出现排卵异常的情况，排卵异常会直接影响怀孕几率。排卵恢复时间差异： 不同女性药流后排卵恢复时间不同，有的可能1个月左右就恢复排卵，有的可能需要2~3个月甚至更长时间。如果排卵恢复延迟，就会相应推迟怀孕时间，而且排卵异常还可能导致月经不调等问题，进一步影响受孕。