避孕药可能会带来一些副作用，比如约10%～20%的女性在服用短效避孕药初期会出现类早孕反应，像恶心、呕吐、头晕等，一般持续1～3个月会逐渐减轻。
月经方面的影响
月经周期改变：部分女性服用避孕药后可能出现月经周期紊乱，有的会使月经提前，有的则会推迟。比如长期服用短效避孕药的女性中，约有5%～10%会出现月经周期明显改变的情况。月经量变化：可能导致月经量减少，甚至有些女性会出现闭经现象，但这种情况相对较少见，一般停药后可恢复。
体重与代谢影响
体重变化：少数人服用避孕药后会出现体重增加的情况，这可能与避孕药中的雌激素引起水钠潴留以及孕激素影响代谢有关，大约有3%～5%的女性会出现体重有所上升的情况。代谢方面：可能对脂代谢有一定影响，有研究发现部分服用避孕药的女性会出现胆固醇、甘油三酯升高等情况，但一般在停药后会逐渐恢复正常。
其他方面影响
情绪变化：个别女性服用避孕药后可能出现情绪波动，比如抑郁、焦虑等情况，不过发生概率较低，约为1%～2%。乳房不适：有些女性会感觉乳房胀痛、触痛，这是因为避孕药中的激素作用于乳房所致，一般在停药后会缓解。