闭经的治疗需根据不同病因来定。如果是下丘脑 - 垂体性闭经，对于有生育要求的患者，可使用促性腺激素等药物来诱导排卵；若是卵巢性闭经，可采用雌激素、孕激素序贯疗法来模拟正常月经周期。一般来说，治疗周期可能需要数月甚至更长时间。
病因不同治疗有别
下丘脑性闭经：
如果是体重过低导致的下丘脑性闭经，需要增加营养摄入，使体重逐渐恢复到正常范围，一般建议每周增加0.5 - 1公斤体重，当体重恢复到正常范围后，月经有可能恢复。而对于因精神压力大等心理因素引起的下丘脑性闭经，需要进行心理疏导，必要时可配合抗焦虑或抗抑郁药物辅助治疗。
垂体性闭经：
如果是垂体肿瘤引起的垂体性闭经，需要根据肿瘤的性质和大小来选择治疗方案。对于泌乳素瘤引起的闭经，常用溴隐亭来降低泌乳素水平，一般需要长期服用溴隐亭，多数患者在服用溴隐亭后泌乳素水平可下降，月经逐渐恢复。
卵巢性闭经：
如果是卵巢早衰引起的闭经，可使用雌激素联合孕激素来建立人工月经周期，一般需要连续用药3 - 6个周期，然后观察月经恢复情况。同时，对于有生育需求的卵巢早衰患者，还可以考虑辅助生殖技术来帮助怀孕。
子宫性闭经：
如果是宫腔粘连导致的子宫性闭经，需要进行宫腔镜下宫腔粘连分离术，术后可放置宫腔内支撑物，并给予雌激素促进子宫内膜生长，一般术后需要连续用药2 - 3个月来促进子宫内膜修复，然后观察月经恢复情况。