小儿口腔溃疡可以使用局部药物来缓解，常用的有西瓜霜喷剂，一般喷后能在一定程度上减轻疼痛、促进愈合。
局部外用药物
西瓜霜喷剂：主要成分有西瓜霜、硼砂等，能起到清热解毒、消肿止痛的作用，可直接喷于口腔溃疡处，减轻小儿口腔溃疡带来的疼痛，促进创面修复，一般小儿可以使用，但要注意喷的时候不要让孩子吸入过多。冰硼散：由冰片、硼砂等组成，有清热解毒、消肿止痛的功效，能缓解口腔溃疡引起的疼痛，促进溃疡面愈合。使用时要注意用量，避免小儿过量吸收。
促进愈合的药物
重组人表皮生长因子凝胶：能促进皮肤与黏膜创面的愈合，小儿口腔溃疡时可以使用，将适量凝胶涂于溃疡表面，能加快溃疡的愈合过程，但要注意在清洁口腔后使用，保持局部清洁。维生素类药物：如维生素B₂，小儿如果是因缺乏维生素B₂导致的口腔溃疡，可以适当补充。维生素B₂参与体内生物氧化与能量代谢等过程，能帮助维持黏膜的正常功能。不过要在医生指导下使用合适的剂量。
缓解疼痛的药物
利多卡因凝胶：对于疼痛较为剧烈的小儿口腔溃疡，在进食前短时间使用利多卡因凝胶可以起到暂时止痛的作用，能让小儿在进食时减轻痛苦，但不能长期频繁使用，且要注意按照医生建议的用量使用。苯佐卡因凝胶：也有局部止痛的效果，能缓解口腔溃疡引起的疼痛，不过同样要谨慎使用，避免小儿过量接触。