6岁儿童肩膀疼可能由以下原因引起：
1.外伤：如果孩子近期有肩部外伤史，如摔倒时用手撑地，可能导致肩关节脱位或骨折，从而引起肩膀疼痛。
2.感染：孩子患流感、手足口病等感染性疾病后，病毒可能侵犯肩关节，引起肩关节滑膜炎，导致肩膀疼痛。
3.肩周炎：肩周炎可发生于任何年龄，但50岁左右的人群更为多见。肩周炎是以肩关节疼痛和活动不便为主要症状的常见病症。6岁儿童患肩周炎的可能性较小，但也不能完全排除。
4.其他：颈椎病、心脏疾病等也可能引起肩部放射性疼痛。
如果孩子出现肩膀疼的症状，建议及时就医，进行相关检查，如X线、CT、磁共振成像（MRI）等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，家长应注意观察孩子的症状变化，避免孩子进行剧烈运动，注意休息。