吃避孕药后痛经很厉害可能由以下原因导致：
一、撤退性出血：
1.服用避孕药后会引发撤退性出血，若出血量与平时月经量相当，可视为一次月经来潮。
2.平时来月经时有痛经症状的女性，在服用避孕药出现撤退性出血时也会有痛经表现，这属于一次非自然状态下的子宫内膜剥脱出血，可能使原有痛经症状加重，可通过物理治疗、口服布洛芬等方式缓解痛经症状。
3.原本没有痛经病史的女性服用紧急避孕药后一般不会因服药而出现痛经症状。
二、流产：
原本没有痛经病史的女性服用紧急避孕药后，若出现严重的痛经症状，则应考虑是否因服用避孕药避孕失败而意外妊娠发生流产，需进一步化验检查以明确诊断和治疗。
三、输卵管炎：
1.输卵管炎一般指由化脓性细菌或淋菌引起的输卵管炎症，也可由病毒感染或衣原体、支原体感染导致。
2.输卵管是盆腔炎症性疾病的最常见发病部位，多合并其他部位炎症，在不孕女性中较为常见，病因是病原体感染，通常在产后、流产后、月经后最易发生。
3.可使用抗生素治疗，如选用头孢西丁钠或头孢替安，其他可选头孢呋辛钠、头孢唑肟钠、头孢曲松钠、头孢噻肟钠等。临床症状改善至少24小时后可转为口服药物治疗，不能耐受多西环素者可用阿奇霉素替代，输卵管卵巢脓肿患者可加用克林霉素或甲硝唑以更有效对抗厌氧菌。
总结：吃避孕药后痛经厉害的原因包括撤退性出血、流产及输卵管炎等，不同情况需采取不同的应对措施，如针对撤退性出血可采取物理或药物止痛，对怀疑流产或输卵管炎等情况则要进一步检查和治疗。