亚急性甲状腺炎常见症状多样，一般起病前1~3周常有上呼吸道感染病史。患者最典型的症状是甲状腺部位疼痛，这种疼痛可从一侧甲状腺开始，很快向其他部位放射，疼痛程度不一，有的患者疼痛较为剧烈，能影响日常活动。
一、全身症状表现
发热情况：多数患者会出现不同程度的发热，体温一般在38℃左右，也有部分患者体温可达到39℃以上，发热可持续数天至数周不等。比如有的患者发热会持续1~2周，然后逐渐消退。全身不适：患者还会感觉全身乏力，没什么精神，食欲也可能受到影响，出现食欲减退的情况，体重可能会有轻度下降。
二、甲状腺局部症状
甲状腺肿大：甲状腺会出现肿大，可一侧先肿大，然后累及另一侧，肿大的甲状腺质地较硬，触痛明显。一般甲状腺肿大的程度不一，有的患者甲状腺轻度肿大，能摸到有结节感，有的患者肿大较为明显，颈部外观能看出甲状腺部位有隆起。甲状腺疼痛特点：除了前面说的疼痛向其他部位放射外，患者在吞咽时疼痛往往会加重，按压甲状腺部位时疼痛也会明显加剧，这给患者带来较大痛苦。
三、其他可能出现的症状
甲状腺功能变化相关症状：疾病早期由于甲状腺滤泡被破坏，甲状腺激素释放进入血液，可能会出现甲亢相关症状，如心慌、手抖、多汗等；随着病情发展，进入恢复期，又可能出现甲减相关表现，如怕冷、嗜睡、反应迟钝等，但这些症状一般是暂时性的，多数患者能恢复正常甲状腺功能。例如部分患者出现心慌时，心率可能会增快到100次/分以上。