经常小腹隐隐作痛可能由多种原因引起。比如女性妇科方面的问题，像盆腔炎，它是女性上生殖道感染性疾病，可表现为下腹部疼痛，病程长者可能会反复出现隐痛，炎症活动期可能伴有发热等症状；还有子宫内膜异位症，患者会出现盆腔痛，疼痛多位于下腹深部及腰骶部，呈周期性加重，部分患者还可能在月经期间疼痛明显加重。
妇科相关原因
盆腔炎： 多由病原体感染引起，性生活活跃的女性尤其是初次性交年龄小、有多个性伴侣、性交过频以及性伴侣有性传播疾病者容易患盆腔炎。除了小腹隐痛，还可能有阴道分泌物增多、异常阴道出血等表现。子宫内膜异位症： 子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位时称为子宫内膜异位症，病因尚不明确，可能与经血逆流、遗传等因素有关。除了小腹隐痛，还可能影响生育，导致不孕。
肠道方面原因
肠易激综合征： 是一种常见的功能性肠病，发病与胃肠动力异常、内脏高敏感、肠道感染后、精神心理障碍等因素有关。患者会出现腹痛，以下腹和左下腹多见，疼痛性质多样，还常伴有排便习惯改变，比如腹泻或便秘，有的患者腹泻和便秘交替出现。慢性结肠炎： 多由急性结肠炎迁延不愈转化而来，也可能与感染、自身免疫等因素有关。患者主要表现为下腹隐痛，伴有腹泻、黏液便等症状，病情容易反复。
泌尿系统原因
膀胱炎： 主要由细菌感染引起，女性发病率高于男性，因为女性尿道短而直，容易被细菌侵入。急性膀胱炎会有尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状，慢性膀胱炎也可能出现小腹隐隐作痛，同时伴有排尿不适等表现。输尿管结石： 多是肾脏结石排入输尿管所致，结石会刺激输尿管黏膜，引起痉挛性疼痛，表现为小腹隐痛或绞痛，疼痛可能会向会阴部放射，还可能伴有血尿等症状。