婴儿长湿疹的原因较为复杂，可能与多种因素相关。据相关研究，约60%的婴儿湿疹与遗传因素有关，如果父母一方有过敏性疾病史，婴儿患湿疹的几率会明显增加。
遗传因素影响
家族过敏史关联： 如果父母双方都有过敏性疾病，比如哮喘、过敏性鼻炎等，那么婴儿长湿疹的概率能达到70%左右；若父母一方有过敏性疾病，婴儿长湿疹的概率也会比正常家庭的婴儿高出不少。基因易感性体现： 婴儿自身的基因中若携带与湿疹相关的易感基因，就更容易受到内外因素刺激而引发湿疹。
皮肤屏障功能不完善
皮肤角质层薄： 婴儿的皮肤角质层比成人薄很多，厚度大约只有成人的1/3，这使得外界的刺激更容易侵入皮肤，从而增加了长湿疹的风险。皮脂分泌少： 婴儿皮肤表面的皮脂分泌相对较少，皮脂有保护皮肤、防止水分流失的作用，皮脂少就会让皮肤的保湿能力下降，皮肤更容易处于干燥状态，进而诱发湿疹。
环境因素作用
温度湿度影响： 当环境温度过高或者湿度过低时，都容易导致婴儿长湿疹。比如在炎热的夏天，室内温度过高且空气干燥，婴儿皮肤的水分流失加快，就容易引发湿疹；而在寒冷干燥的冬季，室内如果供暖后湿度很低，也会让婴儿皮肤变得干燥，增加长湿疹的可能性。接触过敏原： 婴儿接触到一些过敏原也会长湿疹，像尘螨、花粉、动物毛发等。如果室内尘螨数量较多，婴儿接触后就可能引发湿疹反应；在花粉传播的季节，婴儿接触到空气中的花粉，也有可能长湿疹。