治牙周炎常用的四种药一般包括抗生素类、抗厌氧菌药物、非甾体抗炎药等。其中常见的抗生素类药物如阿莫西林，它可以抑制细菌细胞壁的合成，从而发挥抗菌作用；还有头孢菌素类，比如头孢氨苄，能干扰细菌细胞壁的合成过程来达到杀菌效果。抗厌氧菌药物里的甲硝唑，可阻碍细菌代谢，抑制其生长繁殖；替硝唑也是抗厌氧菌的常用药，对大多数厌氧菌有抑制作用。非甾体抗炎药中的布洛芬，能通过抑制环氧化酶的活性，减少前列腺素合成，从而减轻炎症和疼痛；阿司匹林同样有抗炎、镇痛作用，通过抑制前列腺素及其他递质的合成发挥功效。
抗生素类药物
阿莫西林： 属于青霉素类抗生素，对多种细菌有抗菌活性，能帮助控制牙周炎的细菌感染，但对青霉素过敏者禁用。头孢菌素类： 像头孢拉定等，这类药物抗菌谱较广，可用于牙周炎伴有细菌感染的情况，不过使用前需确认患者没有头孢类药物过敏史。
抗厌氧菌药物
甲硝唑： 对厌氧菌有较强的杀灭作用，能有效缓解牙周炎引起的牙龈红肿、疼痛等症状，但孕妇及哺乳期妇女禁用。替硝唑： 抗厌氧菌的效果与甲硝唑类似，副作用相对较轻一些，不过也有一些禁忌人群需要注意。
非甾体抗炎药
布洛芬： 具有抗炎、镇痛、解热作用，能减轻牙周炎导致的疼痛和炎症反应，但是有消化道溃疡病史的患者要慎用。阿司匹林： 也可用于缓解牙周炎带来的疼痛和炎症，不过哮喘患者使用可能会有风险，需谨慎。
局部用药
米诺环素凝胶： 属于局部用的抗生素凝胶，直接作用于牙周袋内，能抑制细菌生长，局部使用副作用相对全身用药要小一些，但对米诺环素过敏者不能用。氯己定含漱液： 是常用的口腔含漱液，能抑制牙菌斑形成，减少细菌数量，帮助改善牙周炎的症状，不过长期使用可能会使牙齿着色，一般使用时间不宜过长。