第三代试管婴儿的成功率受到多种因素影响，一般在40%-60%左右，但具体成功率因个体情况不同而有差异。
年龄因素影响成功率
女性年龄是影响第三代试管成功率的重要因素。通常女性年龄越轻，卵子质量相对越好，成功率相对较高；随着年龄增长，尤其是35岁以后，卵子质量和数量下降，成功率会逐渐降低。男性年龄也有一定影响，年龄过大的男性精子质量可能下降，也会对成功率产生不利影响。
自身疾病状况影响
如果女性存在严重的输卵管疾病、子宫内膜异位症等，或者男性存在严重少精、弱精等问题，都会降低第三代试管的成功率。而本身生殖系统健康状况良好的人群，成功率相对更有保障。
胚胎质量影响
第三代试管会对胚胎进行遗传学检测，优质的胚胎成功率相对更高。如果胚胎本身存在染色体异常等问题，即使进行了检测，移植后成功妊娠的概率也会降低。
心理状态影响
患者的心理状态也会影响成功率。长期处于焦虑、紧张等不良情绪中的患者，可能会通过神经内分泌系统影响身体的内分泌环境，从而影响胚胎着床等过程，导致成功率降低；而保持乐观、放松心态的患者，成功率相对可能更高。