灰指甲常用的治疗药物有外用药物和口服药物。外用药物如30%冰醋酸溶液，一般需要持续使用3~6个月甚至更长时间才能看到效果；还有阿莫罗芬搽剂，每周使用1~2次，连续使用几个月。口服药物常见的有伊曲康唑，采用冲击疗法，即服用1周停3周为一个疗程，一般需要2~3个疗程；还有特比萘芬，每天服用一次，连续服用12周左右，但口服药物有一定的肝毒性风险，需要定期监测肝功能。
外用药物选择
30%冰醋酸溶液：需要用棉签蘸取溶液涂抹在病甲上，每天2~3次，坚持使用。不过它有一定刺激性，使用时要注意避免接触周围正常皮肤。阿莫罗芬搽剂：使用前要先清洁病甲，然后将搽剂均匀涂抹在病甲及周围皮肤上，每周1~2次。它可以渗透进入甲板发挥作用，但价格相对较高。
口服药物特点
伊曲康唑冲击疗法：这种疗法是因为伊曲康唑脂溶性好，餐后立即服用能促进吸收。但在治疗过程中，要定期检查肝功能，因为它可能对肝脏有影响。一般根据指甲生长速度，大拇指指甲生长比较慢，需要的疗程相对长一些。特比萘芬：每天口服一次，它的药物代谢相对快一些，不过同样要关注肝功能情况。对于趾甲灰指甲，由于趾甲生长比手指甲慢，所以需要连续服用的时间更长。
治疗中的注意事项
个人卫生方面：要保持手足清洁干燥，勤换鞋袜，避免与他人共用拖鞋、脚盆等物品，防止交叉感染。比如在公共浴室、游泳池等场所要特别注意，防止再次感染灰指甲。病甲护理：修剪病甲时要注意工具的消毒，避免用同一把剪刀剪病甲和正常指甲，剪完病甲的工具要用酒精消毒。而且病甲不要过度修剪，以免损伤甲周组织。