生殖器疱疹病毒的治疗包括一般治疗、系统药物治疗和外用药物治疗。
一、一般治疗：患者要注重休息，避免饮酒、劳累以及过度性生活。尤其当出现临床症状，如疼痛或是生殖器有簇集、散在的小水疱时，务必避免性生活。
二、系统用药：
1.初发者可按医嘱使用阿昔洛韦等抗病毒药物。
2.复发型可采用间歇疗法，也就是在前驱症状出现前就开始进行治疗；对于频繁复发者，可在医生指导下延长药物服用时间。
三、外用药物：
1.可选用以抗病毒、收敛、干燥和防止继发感染为主的药物，比如3%阿昔洛韦软膏或炉甘石洗剂。
2.继发感染时可应用夫西地酸乳膏、莫匹罗星软膏。
3.如果合并龈口炎，应保持口腔清洁，外用口腔含漱液。
以上这些药物都需在医生的指导下使用，切不可擅自滥用。出现生殖器疱疹的患者应尽快就诊，通过积极治疗并改善生活方式，有希望使疱疹不再复发。
总之，对于生殖器疱疹病毒的治疗，要综合运用多种方法，患者需严格遵医嘱用药并调整生活习惯，以促进病情的良好恢复和防止复发。