小腹有点隐隐疼的原因可能有以下几种：
1.生理性原因：
排卵性腹痛：在两次月经中间，即排卵期出现下腹部胀痛感，这是由于卵泡破裂所致。一般持续时间较短，可伴有轻微的腰部酸痛或下坠感，通常不需要特殊处理。
痛经：青春期女孩在月经前后或月经期间出现下腹疼痛、坠胀，伴有腰酸或其他不适，多为原发性痛经，婚后或生育后可自愈。如果婚后痛经更加严重，需要排除子宫内膜异位症等疾病。
功能性腹痛：多见于青春期女性，常在劳累、运动、精神紧张后出现下腹坠胀、隐痛，休息后可缓解。
2.病理性原因：
盆腔炎：女性内生殖器及其周围结缔组织、盆腔腹膜发生炎症时，可出现下腹部坠胀、疼痛及腰骶部酸痛，常在劳累、性交后及月经前后加剧。
宫颈炎：子宫颈炎可引起下腹部或腰骶部疼痛，并伴有下坠感。
子宫肌瘤：子宫肌瘤较大时，可引起下腹坠胀、疼痛，尤其在性交后或劳累后症状加重。
异位妊娠：受精卵在子宫体腔以外着床发育，称为异位妊娠，其中以输卵管妊娠最为常见。异位妊娠导致的腹痛通常为一侧下腹部隐痛或撕裂样疼痛，伴有阴道流血。
黄体破裂：黄体破裂是妇科常见的急腹症之一，好发于育龄期女性。多在月经后半周期突然发生下腹部疼痛，可伴有恶心、呕吐。
其他：膀胱炎、肾盂肾炎、急性阑尾炎等也可引起小腹疼痛。
如果小腹隐隐疼的症状持续时间较长或伴有其他症状，如发热、恶心、呕吐、阴道流血等，应及时就医，进行相关检查，如B超、血常规、尿常规等，以明确病因，并进行针对性治疗。