附睾炎多由细菌感染引起，常见的致病菌有大肠埃希菌、葡萄球菌等。比如，大约50%的附睾炎是由肠道细菌逆行感染导致的。
感染途径方面
经尿道逆行感染： 这是较为常见的原因。比如，尿道炎患者，细菌可沿输精管逆行侵入附睾引发炎症。像一些不洁的性行为，可能导致性传播疾病，如淋病奈瑟菌、衣原体、支原体感染，进而引发附睾炎。例如，有淋病病史的患者，约20%会并发附睾炎。淋巴蔓延： 盆腔炎症、直肠炎症等可通过淋巴系统蔓延至附睾。比如，患有前列腺炎时，炎症可能通过淋巴途径波及附睾。
身体抵抗力因素
免疫力低下时易发病： 当人体抵抗力下降，如长期熬夜、过度劳累、患有慢性疾病等情况时，身体抵御细菌的能力减弱，容易让细菌入侵附睾引发炎症。比如，糖尿病患者由于自身免疫力相对较低，比正常人更容易患上附睾炎，据统计，糖尿病患者附睾炎的发生率比非糖尿病患者高约3倍。青少年高发： 15~25岁的青少年是附睾炎的高发人群，这与该年龄段性活动频繁有关。此阶段如果不注意生殖器官卫生，或者有不洁性行为等，就容易增加附睾炎的发病风险。
医源性因素
尿道器械操作后： 如留置导尿管、尿道扩张术等操作后，可能会损伤尿道黏膜，细菌容易侵入并蔓延至附睾引起炎症。比如，进行尿道镜检查后，有1%~2%的患者会发生附睾炎。前列腺切除术后： 尤其是经尿道前列腺电切术后，由于射精管开口在前列腺窝，排尿时压力可将尿液逆流进射精管，尿液中的细菌可导致附睾炎。一般术后1周左右可能出现附睾炎症状。