新生儿乳糖不耐受主要表现为消化系统相关症状。一般来说，新生儿乳糖不耐受时，通常会有大便次数增多的情况，每天可能达到数次甚至十几次。
大便的表现
大便性状改变： 大便多为黄色或青绿色稀糊便，或呈蛋花汤样，泡沫较多，有奶块。这是因为乳糖不耐受导致肠道内渗透压改变，水分进入肠道引起腹泻，进而使大便性状发生变化。大便气味： 可能会有酸臭味，这是由于未消化的乳糖在肠道被细菌发酵产生酸性物质所致。
胃肠道不适表现
腹胀： 新生儿可能会出现肚子胀的情况，这是因为肠道内气体增多，气体在肠道内积聚就会导致腹胀。可以观察到新生儿的腹部看起来比较饱满，用手轻轻触摸能感觉到腹部有胀气。肠痉挛： 有的新生儿会出现肠痉挛，表现为突然哭闹不安，持续时间较短但容易反复。这是因为肠道内乳糖不能正常消化吸收，刺激肠道引起痉挛。
其他可能表现
生长发育受影响： 如果新生儿长期乳糖不耐受，可能会影响营养物质的吸收，进而影响生长发育。比如体重增长可能不达标，因为乳糖是新生儿重要的能量来源之一，不能正常消化吸收乳糖会导致能量摄入不足，影响体重的增加。吐奶： 部分新生儿可能会出现吐奶的情况，这与肠道不适导致的胃肠道功能紊乱有关，食物不能很好地在胃肠道内消化吸收，就容易出现吐奶现象。