胃肠道功能紊乱的症状多样，常见的有消化系统相关症状以及可能伴随的全身表现等。一般来说，其消化系统方面的症状较为突出。
消化系统常见症状
腹痛：
腹痛是胃肠道功能紊乱较常见的症状之一。疼痛部位不固定，可能在脐周、上腹部等，疼痛性质多样，可为隐痛、胀痛、绞痛等。比如有的患者会感觉肚子里隐隐作痛，持续时间不等，短则几分钟，长则数小时。
腹胀：
患者常自觉腹部胀满，尤其是进食后更为明显。可能会看到腹部膨隆，自己能感觉到肚子里有气体积聚，导致腹部有饱胀感，影响食欲。例如吃了一点东西就觉得肚子很胀，不想再进食。
恶心呕吐：
部分胃肠道功能紊乱的患者会出现恶心症状，严重时可伴有呕吐。呕吐物多为胃内容物，一般无血性或胆汁样物质，但频繁呕吐可能会导致脱水等情况。比如早上起来可能会感觉恶心，偶尔会吐出前一晚吃的食物。
食欲改变：
有的患者会出现食欲减退，对食物不感兴趣，食量明显减少；而少数患者可能会出现食欲亢进，总是感觉饿，不停想吃东西，但进食后又会出现腹胀等不适。
可能伴随的全身表现
精神神经系统症状：
患者可能伴有精神方面的症状，如焦虑、抑郁、失眠等。因为胃肠道和神经系统关系密切，胃肠道功能紊乱可能会影响神经功能，进而出现精神状态的改变。比如有的患者会因为胃肠道不适而长期处于焦虑状态，晚上难以入睡，睡眠质量差。
其他表现：
部分患者还可能出现乏力等全身不适症状。由于胃肠道功能紊乱影响了营养物质的消化吸收，身体得不到充足的能量供应，就会感觉浑身没力气，影响日常生活和工作。