扁平疣和寻常疣都是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的皮肤病，它们的区别主要在于以下几个方面：
1.好发部位：扁平疣好发于面部、手背、前臂等部位；寻常疣好发于手指、手背、足缘等部位。
2.皮疹特点：扁平疣表现为扁平丘疹，表面光滑，质地较硬，可呈圆形、椭圆形或多角形，颜色为正常肤色或淡褐色；寻常疣表现为突出于皮肤表面的丘疹，质地较硬，表面粗糙，呈乳头瘤样增生，颜色为灰褐色或正常肤色。
3.传染性：扁平疣具有传染性，可通过直接接触或间接接触传播；寻常疣一般不具有传染性。
4.病程：扁平疣病程较长，可持续数年或数十年；寻常疣病程相对较短，一般在1-2年内可自行消退。
5.治疗方法：扁平疣和寻常疣的治疗方法相似，包括外用药物、物理治疗和手术治疗等。外用药物包括维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等；物理治疗包括冷冻治疗、激光治疗、电灼治疗等；手术治疗适用于疣体较大或药物治疗无效的患者。
扁平疣和寻常疣一般不会对健康造成严重影响，但如果疣体数量较多、面积较大，可能会影响美观；如果疣体发生在足底等部位，可能会影响行走。此外，扁平疣和寻常疣还可能会传染给他人，因此需要及时治疗。