宫外孕的发生与多种因素相关。据统计，大约1%的妊娠会发生宫外孕。
输卵管因素
输卵管炎症：这是宫外孕最常见的原因。比如淋菌性或沙眼衣原体感染引起的输卵管炎，会使输卵管黏膜粘连、管腔变窄，影响受精卵的正常运行。输卵管黏膜炎轻者可使黏膜皱褶粘连，管腔变窄，或使纤毛功能受损，从而导致受精卵在输卵管内运行受阻而着床。输卵管手术史：有过输卵管手术的女性，发生宫外孕的风险会增加。例如曾经做过输卵管再通术、输卵管粘连分离术等，手术可能会导致输卵管结构异常，影响受精卵的运输。比如做过输卵管结扎后复通手术的女性，输卵管的结构和功能可能不如正常情况，受精卵就容易在输卵管内着床。
宫腔环境因素
宫腔操作史：多次人工流产等宫腔操作会增加宫外孕的发生率。因为人工流产可能引起子宫内膜损伤、感染，导致宫腔粘连等问题，影响受精卵着床的位置，使受精卵更容易在输卵管等部位着床。比如频繁进行人工流产的女性，子宫内膜受到多次创伤，受精卵难以在子宫腔内正常着床，就容易跑到输卵管等地方形成宫外孕。子宫肌瘤或卵巢囊肿：子宫肌瘤或者卵巢囊肿可能会压迫输卵管，影响受精卵的正常运行。例如较大的子宫肌瘤可能会改变输卵管的正常解剖位置，使受精卵在运行过程中受阻，从而在输卵管处着床。卵巢囊肿如果压迫输卵管，也会影响受精卵向子宫腔的移动，增加宫外孕的发生几率。
受精卵自身因素
受精卵游走：受精卵在一侧输卵管受精后，沿着伞端向对侧输卵管运行，由于运行时间过长，受精卵没有到达子宫腔，就在对侧输卵管着床，形成宫外孕。一般来说，受精卵从受精到运行到子宫腔需要一定时间，如果这个过程出现异常，就可能发生游走导致宫外孕。受精卵发育异常：有些受精卵本身发育存在问题，比如染色体异常等情况，会影响其正常着床。异常的受精卵可能无法正常在子宫腔内着床，而选择在输卵管等部位着床，从而引发宫外孕。