隐匿性肾炎主要通过临床表现、尿液检查等方面来判断。通常可从症状表现、尿液检查、肾功能检查等方面综合判断。
症状表现方面
无症状性血尿： 患者可能会有无痛性肉眼血尿或镜下血尿，肉眼血尿时尿液颜色可呈洗肉水样等，但一般没有其他明显不适症状，比如没有腰痛、水肿等表现。无症状性蛋白尿： 尿中蛋白含量有所增加，但通常24小时尿蛋白定量一般少于1克，患者也没有明显的水肿、高血压等其他典型肾炎表现。
尿液检查方面
尿常规检查： 镜下可见红细胞增多，可能以畸形红细胞为主，这是因为红细胞通过受损的肾小球基底膜时发生变形。同时尿蛋白检测呈阳性，但一般定量不是很高。尿相差显微镜检查： 通过该检查可以区分血尿是肾小球源性还是非肾小球源性，隐匿性肾炎导致的血尿多为肾小球源性血尿，即畸形红细胞占比增多。
肾功能检查方面
肾小球滤过率测定： 隐匿性肾炎患者的肾小球滤过率一般在正常范围内，通过检测血肌酐等指标来评估，血肌酐水平通常不会明显升高，说明肾脏的基本滤过功能还没有受到严重影响。肾功能其他指标： 如尿素氮等指标一般也在正常范围，进一步提示肾脏整体功能暂时未出现严重损害。
病史及其他检查方面
病史询
问： 要询问患者既往是否有过泌尿系统感染等病史，不过隐匿性肾炎患者既往病史往往没有特殊指向性导致肾炎的明确病史。其他相关检查： 可能还需要进行B超等检查，排除泌尿系统结石、肿瘤等其他疾病导致的类似表现，因为这些疾病也可能出现血尿等情况，通过B超等检查可以帮助鉴别诊断，排除其他病因后更支持隐匿性肾炎的判断。