痣疣主要是由人类乳头瘤病毒（HPV）感染引起的。HPV有多种亚型，不同亚型会导致不同类型的痣疣。比如，常见的寻常疣多由HPV-2型引起，而跖疣常与HPV-1型相关。
病毒感染因素
HPV的接触传播： 直接接触是HPV传播的重要途径。比如，与长有痣疣的人握手，或者接触了被HPV污染的毛巾、衣物等物品，都有可能感染HPV从而引发痣疣。一般来说，皮肤有破损时更容易感染HPV。自身接种传播： 长了痣疣的人，用手搔抓患处后，再接触身体其他部位，就可能把病毒带到其他部位，导致新的痣疣出现。例如，手上长了寻常疣，搔抓后又去抓脚部，就可能在脚部长出跖疣。
皮肤状态与免疫力因素
皮肤破损与痣疣： 当皮肤出现微小破损时，比如被指甲划伤、摩擦破损等，HPV就更容易侵入皮肤细胞。像经常从事体力劳动的人，手部皮肤容易有小的破损，相对来说更容易长痣疣。免疫力低下人群： 免疫力较弱的人，比如患有某些疾病（如艾滋病）、长期使用免疫抑制剂的人，对HPV的抵抗力下降，更容易感染HPV并发展成痣疣。儿童和老年人由于免疫系统相对不够完善或功能有所衰退，也比正常人更易长痣疣。
环境因素影响
公共环境因素： 在公共浴室、游泳池等公共场所，如果卫生条件不佳，存在HPV污染的可能。比如公共浴室的地面、毛巾等，都有可能残留HPV，接触后就有感染风险。潮湿环境与痣疣： 潮湿的环境有利于HPV的存活和传播。比如脚部长期处于潮湿状态，就为HPV感染提供了便利条件，所以跖疣在多汗、潮湿的人群中更为常见。