脖子上长扁平疣可采取多种方式治疗，包括药物治疗（外用药物、口服药物）、手术治疗以及物理治疗等。在治疗期间需注意避免直接搔抓患处，保持局部皮肤清洁干燥。具体如下：
一、外用药物：
1.可遵医嘱外用维A酸乳膏、他扎罗汀乳膏等，能调节脖子部位皮肤的上皮细胞增殖从而发挥治疗作用。
2.也可遵医嘱使用水杨酸类药物等，可促进表皮剥脱。
二、口服药物：目前暂无治疗扁平疣的特效口服药物，病情较重时可遵医嘱使用免疫调节剂，如复方丙谷胺西咪替丁片、盐酸左旋咪唑片等进行治疗。
三、手术治疗：主要是通过手术将自体疣植入皮下脂肪层，这样能产生抗病毒抗体以及清除表皮上的人乳头瘤病毒，可降低复发几率，原理与疫苗接种较为接近。
四、物理治疗：
1.通常可采用冷冻方式改善，冷冻治疗主要通过液氮低温使皮层坏死或脱落，一般需经过多次治疗才可达到较好效果。
2.激光治疗可选择脉冲染料激光，通过高温使皮损坏死或脱落以祛除疣体，治疗时可能会出现轻微疼痛。
总之，对于脖子上的扁平疣，有多种治疗手段可供选择，可根据具体情况在医生指导下进行合适的治疗。同时，要做好患处护理。