2岁宝宝发烧39℃，首先要采取以下措施。
一、药物治疗：对于发烧达39℃的宝宝，可通过口服退烧药来调控体温，比如布洛芬或乙酰氨基酚，也可将退热栓塞入肛门进行治疗。
1.如果使用退烧药后温度显著下降，且未出现反复发烧的情况，那么体温基本得到控制。
2.若使用退烧药后体温下降不明显，或者总是出现反复发烧，就需要前往医院检查，明确病因后进行针对性治疗。
二、物理降温：可以给孩子洗温水浴，以帮助孩子散热，还能使用温水擦拭额头、腋下等部位来降低宝宝体温，同时要让孩子多喝水，促进身体代谢，通过尿液排出的方式帮助孩子降温，但一定要注意做好保暖，避免着凉而加重病情。
总之，当2岁宝宝发烧39℃时，要及时进行药物治疗和配合物理降温，密切关注孩子状况，根据具体情况采取相应措施。