扁平疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的良性赘生物，治疗方法有多种。一般来说，治疗扁平疣可以采用药物治疗、物理治疗等方式。
药物治疗
外用药物： 常用的有维A酸类药物，像维A酸乳膏，它可以调节细胞分化，促使疣体脱落，但使用时可能会有局部刺激症状，如轻度的红斑、脱屑等。还有5%的咪喹莫特乳膏，它是一种免疫调节剂，通过刺激机体的免疫系统来发挥作用，但部分人使用后可能会出现局部炎症反应。内服药物： 对于病情较严重的患者，可能会使用免疫调节剂，如转移因子口服液等，它能调节机体免疫功能，帮助清除病毒，但起效相对较慢。
物理治疗
冷冻治疗： 利用低温使疣体坏死脱落。一般需要多次治疗，间隔时间约2-3周。治疗时会有一定疼痛，治疗后局部可能会出现水疱、结痂，要注意保持局部清洁，避免感染。激光治疗： 用激光的高能量烧灼疣体，使其去除。治疗过程较快，但术后要注意创面护理，防止感染，可能会留下轻微疤痕，不过对于较小的疣体效果较好。电灼治疗： 通过电流烧灼疣体，适用于较小的扁平疣。治疗时会有灼热感，术后同样要注意预防感染，恢复期间要保持局部干燥。
中医治疗
中药内服： 根据患者的体质辨证论治，如风热蕴结型，可能会用疏风清热、解毒散结的方剂，像马齿苋合剂等；对于肝虚血燥型，会采用养血平肝、活血祛风的药物。但中药治疗需要较长时间坚持服用，且效果因人而异。中药外用： 可以用中药煎水外洗，比如用板蓝根、大青叶、马齿苋、木贼草等中药煎水后外洗患处，有一定的抗病毒、消疣作用，但外洗时要注意温度，避免烫伤皮肤。需要注意的是，不同的治疗方法适用于不同情况的患者，在选择治疗方法时要根据疣体的大小、数量、部位以及患者的自身情况等综合考虑。同时，治疗后要注意观察恢复情况，如有异常应及时就医。而且，扁平疣具有一定传染性，要避免搔抓疣体，防止自身接种传播。