肝功能异常通常由多种原因引起。比如病毒性肝炎就是常见原因之一，像乙型肝炎病毒感染，据统计全球约有2.57亿慢性乙肝病毒感染者，乙肝病毒会攻击肝细胞，导致肝功能出现异常。
一、感染因素导致肝功能异常
病毒性肝炎： 除了乙肝病毒，丙肝病毒感染也会引发肝功能异常。丙肝病毒主要通过血液传播等途径，入侵人体后在肝细胞内复制，破坏肝细胞结构和功能，进而影响肝功能指标。寄生虫感染： 比如肝吸虫感染，人食用了未煮熟的含有肝吸虫囊蚴的淡水鱼虾后，肝吸虫会在肝胆管内寄生，引起胆管炎、胆管上皮增生等，从而导致肝功能异常。
二、药物或毒物因素造成肝功能异常
药物性肝损伤： 许多药物都可能对肝脏有损害，像抗结核药异烟肼，部分人服用后可能出现肝功能异常情况，这是因为异烟肼在体内代谢过程中会产生一些有毒代谢产物，损伤肝细胞。毒物接触： 长期接触某些有毒化学物质，如四氯化碳，它进入人体后会在肝脏代谢，产生的自由基等物质会损伤肝细胞，导致肝功能出现异常变化。
三、自身免疫因素引发肝功能异常
自身免疫性肝炎： 这是一种由自身免疫反应介导的肝脏炎症性疾病，机体免疫系统错误地攻击自身肝细胞，导致肝细胞受损，引起肝功能异常，这种疾病多见于女性，发病机制与自身免疫调节紊乱有关。原发性胆汁性胆管炎： 也是自身免疫相关的肝病，免疫系统攻击胆管上皮细胞，导致胆管破坏、胆汁淤积，进而影响肝脏正常功能，使肝功能指标发生改变。
四、代谢相关因素导致肝功能异常
脂肪肝： 尤其是非酒精性脂肪肝，与肥胖、高脂饮食、缺乏运动等因素密切相关。当肝脏内脂肪堆积过多时，会影响肝细胞的正常代谢和功能，导致肝功能异常，据统计我国成人脂肪肝患病率已达12.5%~35.4%。糖尿病相关肝损伤： 糖尿病患者如果血糖控制不佳，长期高血糖状态会影响肝脏的代谢功能，可能导致肝功能异常，因为血糖代谢异常会干扰肝脏内的一系列生化反应，损伤肝细胞。