药流最佳时机一般是怀孕后的49天以内。在这个时间段内，孕囊大小合适，进行药物流产的成功率相对较高，对身体的损伤也相对较小。
怀孕天数的计算方式
孕周是从最后一次月经的第一天开始计算的。比如，末次月经第一天是1月1日，那么到3月12日时，孕周大概是10周左右。但药流适宜的时间是按怀孕天数来算，即怀孕小于等于49天。
不同孕周药流的差异
孕周小于42天： 此时孕囊较小，直径通常在1 - 2厘米左右，药物流产的完全流产率相对较高，不过也存在个体差异，有些女性可能孕囊着床位置特殊等情况会影响效果。孕周在42 - 49天： 孕囊直径一般在2 - 3厘米，这个阶段进行药流，只要严格把握适应证和禁忌证，多数也能顺利排出孕囊。但相对孕周更小的时候，子宫对药物的敏感性可能会稍有不同。
药流的禁忌情况
宫外孕患者： 宫外孕是不能进行药流的，因为药流药物无法作用于异位的孕囊，还可能导致宫外孕破裂等严重后果，所以在药流前必须通过B超等检查排除宫外孕。有严重心、肝、肾疾病患者： 这类患者身体状况不允许进行药流，因为药流过程中使用的药物可能会对心、肝、肾等重要脏器功能产生一定影响，加重病情。过敏体质者： 如果对药流所用药物中的成分过敏，是不能进行药流的，否则可能会出现严重的过敏反应，危及生命安全。