骨纤维异常增殖症的病因目前尚不完全明确，不过有一些相关因素被认为可能与之有关。
遗传因素相关情况
基因突变方面：有研究发现，部分骨纤维异常增殖症患者存在特定的基因突变情况。比如，相关基因的突变可能会影响骨组织的正常生长和发育调控，从而导致骨纤维异常增殖症的发生。但具体的基因突变位点和机制还在不断深入研究中。家族遗传倾向：虽然不是所有患者都有明确的家族遗传史，但有一定的家族聚集现象被观察到。如果家族中有亲属患有骨纤维异常增殖症，那么其他家族成员患该病的风险可能会相对有所升高，但这也不是绝对的，只是存在一定的遗传易感性。
胚胎发育因素
胚胎时期发育异常：在胚胎发育的早期阶段，骨组织的分化和形成过程中出现异常。比如，在胚胎发育的某个关键时期，间充质细胞的分化出现偏差，导致成骨细胞的功能和分化受到影响，使得骨组织被异常的纤维组织所替代，进而引发骨纤维异常增殖症。这种胚胎时期的发育异常可能是多种因素共同作用导致的，包括一些未知的环境因素和遗传因素的综合影响。
内分泌因素影响
激素水平异常：体内某些激素水平的异常可能与骨纤维异常增殖症的发生有关。例如，生长激素、雌激素等激素的水平变化可能会影响骨的代谢和生长。当这些激素的平衡被打破时，可能会干扰骨组织的正常更新和修复过程，使得骨纤维异常增殖症有可乘之机。不过，目前对于激素与骨纤维异常增殖症具体的关联机制还需要进一步大量的研究来明确。