脑仁疼一晃就疼且时轻时重，可能由多种原因引起。一般来说，这种情况可能涉及多种因素导致的头痛表现。
可能的常见原因
紧张性头痛相关
肌肉紧张因素：长时间保持不良姿势，比如长时间低头看手机、电脑，颈部和头部的肌肉会持续处于紧张状态，就可能引发脑仁疼，一晃的时候这种紧张可能会加重疼痛，疼痛程度时轻时重。压力情绪影响：长期处于高压力状态或者情绪紧张、焦虑时，也容易出现紧张性头痛，表现为脑仁部位一晃就疼，疼痛程度随情绪和压力变化时轻时重。
偏头痛相关情况
血管波动影响：偏头痛发作时，头部血管会出现异常波动，可能导致脑仁疼，当头部晃动时，血管波动变化可能使疼痛有轻重不同的表现。部分偏头痛患者疼痛程度在发作过程中会有起伏，时轻时重。遗传因素关联：如果家族中有偏头痛病史，那么自身患偏头痛引发脑仁疼一晃就疼时轻时重的可能性会增加，大约有60%的偏头痛患者有家族遗传倾向。
颅内疾病初步排查
颅内炎症可能：虽然相对少见，但颅内感染等炎症性疾病也可能导致脑仁疼一晃就疼且时轻时重，不过一般还会伴随发热、恶心等其他症状，当然这只是初步需要考虑排查的情况。颅内占位需警惕：颅内长有肿瘤等占位性病变时，也可能出现脑仁疼一晃就疼的情况，不过这种情况往往还会有进行性加重的趋势，但也有疼痛时轻时重的个别表现，需要进一步通过影像学等检查来明确。
如何初步判断情况
观察伴随症状
伴恶心呕吐：如果脑仁疼一晃就疼时轻时重还伴有恶心、呕吐症状，那偏头痛或者颅内病变的可能性相对大一些。伴发热：要是同时有发热表现，颅内炎症的可能性要考虑进去。
了解诱发因素
是否因劳累诱发：如果是因为最近过度劳累后出现脑仁疼一晃就疼时轻时重，那紧张性头痛的可能性较高。是否有头部外伤史：如果有头部外伤史后出现这样的疼痛，那就得格外警惕颅内是否有损伤等情况，需要及时就医检查。