口腔粘膜病的治疗方法需根据具体类型而定。一般来说，治疗口腔粘膜病可通过局部用药、全身用药等方式。比如复发性阿弗他溃疡，局部可使用含漱剂如氯己定含漱液，能起到一定的抗菌消炎作用。
局部治疗方法
含漱类药物： 像氯己定含漱液，它可以抑制口腔内的细菌生长，对于一些由细菌感染引起的口腔粘膜炎症有一定的缓解作用，通常每天使用2 - 3次，每次含漱10 - 20毫升左右。涂抹类药物： 例如糖皮质激素软膏，如地塞米松软膏，对于口腔粘膜的扁平苔藓等疾病有一定的抗炎作用，直接涂抹在病变部位，但要注意使用频率和疗程需遵医嘱。
全身治疗考量
维生素补充： 对于因维生素缺乏引起的口腔粘膜病，比如维生素B2缺乏导致的口角炎等，可补充维生素B2。一般成人每天补充量约5 - 10毫克，但要注意过量补充也可能有不良反应。免疫调节药物： 当口腔粘膜病与自身免疫有关时，可能会用到免疫调节药物，如转移因子，它可以调节机体免疫功能，但使用时要根据患者的具体免疫状态由医生判断是否适用。
不同病症的针对性处理
疱疹性口炎： 由单纯疱疹病毒引起，可使用抗病毒药物，如阿昔洛韦，它能抑制病毒DNA合成，起到抗病毒的作用，但儿童使用时要特别注意剂量和不良反应。白斑： 对于口腔白斑，若有癌变倾向等情况，可能需要手术切除等治疗方式，但也可配合一些维A酸类药物辅助治疗，不过维A酸类药物可能会有局部刺激等不良反应，需在医生指导下使用。