宝宝打完流脑疫苗后发烧可能是正常反应。可采取以下方式处理：
一、物理降温：注射流脑疫苗后大概三天左右可能出现轻微发烧，若体温未超过38.5度，通常是正常现象。可通过以下物理方法降温，如使用退热贴，让患儿多喝温开水等，发烧现象一般在一到两天左右会慢慢消失。
二、药物治疗：若发烧超过38.5度，可能并非单纯由注射流脑疫苗引起，也可能存在炎症感染，此时要及时观察患儿是否有其他不适症状。应带患儿到正规医院检查，配合医生服用退烧药物进行治疗。在治疗期间要注意身体保暖，避免着凉，同时注意休息，保证充足睡眠，饮食上以清淡为主，适量多喝温开水。
尾段总结：总之，宝宝打完流脑疫苗后发烧要根据具体情况选择合适的处理方法，低热可先尝试物理降温，高热或伴有其他异常则需就医并药物治疗，同时要做好各方面护理。