疟疾病主要的问题包括传播广泛、诊断与治疗有挑战以及对健康的严重损害等。全球每年约有2亿多例疟疾病例，对公共卫生构成重大威胁。
传播方面的问题
蚊媒传播风险高：疟疾主要通过按蚊叮咬传播，在热带和亚热带地区，按蚊生存环境适宜，使得疟疾传播容易大范围发生。例如在一些非洲国家，由于气候温暖湿润，按蚊滋生条件良好，疟疾传播较为猖獗。人群易感性普遍：人群普遍对疟疾易感，尤其是儿童、孕妇和免疫力低下的人群。儿童免疫系统尚未完全发育，孕妇在怀孕期间免疫力相对降低，更容易感染疟疾且病情可能更严重。
诊断方面的问题
症状易混淆：疟疾的症状如发热、寒战、乏力等与其他一些发热性疾病症状相似，容易造成误诊。比如普通感冒也可能有发热、乏力症状，这就会干扰医生对疟疾的准确判断。检测技术要求较高：疟疾的实验室检测需要专业的设备和技术人员。在一些医疗资源匮乏的地区，可能缺乏足够的检测设备和专业人员，导致疟疾不能被及时准确诊断，从而延误治疗。
治疗方面的问题
抗药性问题凸显：疟原虫对常用抗疟药物逐渐产生抗药性，像氯喹等药物在一些地区的抗疟效果明显下降。这使得治疗疟疾变得更加困难，需要不断研发新的抗疟药物来应对。重症疟疾死亡率较高：如果疟疾得不到及时有效的治疗，容易发展为重症疟疾，重症疟疾的死亡率相对较高。例如脑型疟疾是重症疟疾的一种严重类型，若不及时救治，患者死亡率可达20% - 30%左右。
对健康长期影响的问题
贫血问题：疟疾发作时会破坏红细胞，导致患者出现贫血症状。长期反复感染疟疾的患者，贫血可能会持续存在，影响身体的正常机能，表现为面色苍白、乏力等，还会降低身体的抵抗力。智力发育受影响：儿童时期患疟疾如果没有得到良好控制，可能会影响智力发育。有研究表明，5岁以下儿童患重症疟疾后，约有一定比例的儿童在智力发育方面会出现不同程度的迟缓。