右侧睾丸疼痛多数时候由附睾炎导致。附睾炎以附睾肿胀和疼痛为主要临床特征，是常见的男性生殖系统炎症疾病，多发于中青年。当身体抵抗力弱时，大肠杆菌、葡萄球菌、链球菌等致病菌会进入输精管，逆行侵入附睾引发炎症，也可因不洁性行为致淋病，或沙眼衣原体感染引起，还可由之前存在的尿路感染或其他邻近器官炎症扩散导致。
急性附睾炎的治疗，除了一般对症治疗以缓解疼痛、肿胀等症状外，主要有以下方式：
一、药物治疗：
1.急性附睾炎：要选择对细菌敏感的药物，通常静脉给药持续1至2周，为防炎症转慢性，需继续口服抗菌药物2至4周。常用药物包括头孢菌素类、喹诺酮类、大环内酯类等。由性传播感染引起的多选用头孢类药物，加用强力霉素、左氧氟沙星等；大肠杆菌感染引起的多首选氧氟沙星或左氧氟沙星。
2.慢性附睾炎：以口服抗生素治疗为主，合并急性发作时可予抗生素治疗。一般先凭经验用药，等细菌培养和药敏试验结果出来后，再选针对性抗生素，疗程一般为2周。若患者同时有慢性前列腺炎，必须同时治疗，以免因感染源处理不彻底而反复。
二、手术治疗：
1.急性附睾炎：抗菌药物治疗效果不佳，或怀疑附睾缺血时，需进行附睾切开减压，手术中应尽量避免损伤附睾管，若能同时切开邻近的精索外筋膜，改善睾丸血液循环效果更好。若炎性包块增大且有波动感，提示有脓肿形成，应及时切开引流。
2.慢性附睾炎：对多次反复发作且其他治疗方式效果不理想的，尤其是结核性附睾炎抗结核治疗无效时，可考虑做附睾切除。
总之，急性附睾炎的治疗要综合考虑，既要缓解症状，又要防止转为慢性，还要避免潜在感染传播和预防并发症等。慢性附睾炎的治疗则要根据具体情况选择合适的方法。