经期不规律时月经结束后第三天同房，需要关注多个方面。一般来说，月经周期不规律的女性，月经结束后第三天同房有一定怀孕风险，但相对安全期而言风险较低，不过仍需注意一些健康问题。
受孕风险情况
对于月经周期不规律的女性，月经结束后第三天同房怀孕几率相对不是特别高，但也不是绝对安全。因为有些女性可能会出现额外排卵的情况，比如部分女性的排卵时间并不固定，可能会在月经结束后较短时间内就排卵。一般月经周期规律的女性排卵期在下次月经前14天左右，但月经不规律者很难精准推算排卵期，所以此时同房仍有受孕可能。
妇科健康影响
同房时要注意卫生，否则容易引发妇科炎症。如果本身经期不规律，阴道内环境可能相对不稳定，此时同房若不注意卫生，细菌等病原体容易侵入阴道、宫颈甚至子宫等部位，增加阴道炎、宫颈炎等妇科炎症的发生风险。比如可能会出现白带增多、异味、瘙痒等症状，严重时还可能导致腹痛等不适。
心理及其他影响
经期不规律可能会给女性带来一定心理压力，而同房时的情绪等也会有影响。如果因为担心受孕或妇科健康问题而产生焦虑等情绪，可能会进一步影响月经周期，形成恶性循环。另外，同房时的姿势、力度等也需要注意，不合适的情况可能会引起身体不适。同时，对于月经不规律的女性，应积极寻找导致经期不规律的原因，如内分泌失调、多囊卵巢综合征等，必要时就医检查和治疗，而不是仅关注同房这一行为，要从整体健康角度来综合看待经期不规律以及相关同房情况。