怀孕35天药物流产通常可以流干净，但一定不能私自服药，必须在医生指导下进行。药物流产适合停经49日以内、确定为宫内妊娠、年龄40岁以下且自愿结束妊娠的妇女。
一、药物流产前要进行多项检查：
1.需做尿妊娠试验和B超检查，以明确孕期。
2.还要做阴道清洁度、滴虫和霉菌检查，若存在阴道感染或炎症，必须先治疗才能进行药流，因为药流后身体抵抗力会下降，若不控制炎症及进行抗菌治疗，会有很大感染风险。
二、药流过程中最好有家属陪同。最后一次服药后，要密切关注阴道流血情况，多数患者孕囊在3天左右流出，阴道流血时间一般持续7到10天。
三、建议在医院进行药流，若在家中进行，要将流出物送医院检查以确定药流是否成功，若忘记保留流出物，医生会通过B超检查等方式来判断孕囊是否排出。
总之，怀孕后选择药物流产要谨慎，严格按照医生要求进行各项检查和操作，密切观察流产过程中的情况，以确保流产安全有效。