射精功能障碍的原因较多，其中心理因素较为常见，约有10%-20%的射精功能障碍患者是由心理因素引起，比如长期的焦虑、抑郁、紧张等情绪，或者对性有错误的认知等。
心理性因素
压力与焦虑：长期处于工作、生活等多方面的巨大压力下，或者面临重大生活事件时，如失业、亲人离世等，容易产生焦虑情绪，进而影响射精功能。比如一些职场人士长期工作压力大，可能会出现射精障碍。抑郁情绪：患有抑郁症的人，往往情绪低落、兴趣减退，也可能伴随射精功能障碍，据统计，约30%-50%的抑郁症患者会出现射精方面的问题。
器质性因素
神经系统病变：像脊髓损伤、多发性硬化症等神经系统疾病，会影响神经对射精反射的调控。例如脊髓损伤患者，由于神经传导受到破坏，可能出现射精障碍。内分泌疾病：糖尿病是常见的能引起射精功能障碍的内分泌疾病，糖尿病患者长期高血糖状态会损害神经和血管，影响射精过程。另外，垂体功能减退等内分泌异常也可能导致射精问题。生殖系统疾病：附睾炎、附睾结核等生殖系统的炎症性疾病，或者前列腺增生、前列腺癌等前列腺疾病，都可能影响射精相关的结构和功能。比如慢性附睾炎患者，炎症刺激可能干扰正常的射精过程。
医源性因素
手术影响：前列腺癌根治术、膀胱癌根治术等盆腔部位的手术，可能会损伤射精相关的神经和结构，导致射精功能障碍。一般这类手术后，约有20%-80%的患者会出现不同程度的射精问题。药物副作用：一些药物在使用过程中可能引起射精功能障碍，比如抗高血压药中的利血平、胍乙啶等，抗精神病药中的氯丙嗪、氟哌啶醇等。长期服用这些药物的人，需要留意是否出现射精方面的异常表现。