在服用黄体酮胶囊后出现深褐色分泌物，可能是以下原因引起：
1.药物副作用：黄体酮胶囊是一种孕激素药物，服用后可能会出现突破性出血、阴道点状出血、体重增加或减少、宫颈鳞柱交界改变、宫颈分泌物性状改变、乳房肿胀、恶心、头晕、头痛、倦怠感、发热、失眠、过敏伴或不伴瘙痒等不良反应。突破性出血和阴道点状出血一般发生在突破性出血，通常发生在漏服药之后，也可能发生在剂量调整之后。
2.先兆流产或宫外孕：如果已经怀孕，服用黄体酮胶囊后出现深褐色分泌物，可能是先兆流产或宫外孕引起。需要及时就医，进行B超、血HCG和孕酮等检查，以明确诊断。
3.其他妇科疾病：子宫内膜息肉、子宫肌瘤、子宫内膜异位症等妇科疾病也可能导致服用黄体酮胶囊后出现深褐色分泌物。
4.其他因素：内分泌失调、宫颈病变、排卵期出血等也可能出现类似症状。
需要注意的是，每个人的身体状况和对药物的反应都可能不同，如果出现深褐色分泌物，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以确定具体原因，并采取相应的治疗措施。同时，在服用黄体酮胶囊期间，应遵医嘱用药，不要自行增减剂量或停药。如果出现其他不适症状，也应及时告知医生。