婴儿时不时咳嗽两声且伴有干呕，可能与扁桃体炎、支气管炎、胃食管反流、气管异物等有关。具体如下：
一、扁桃体炎：婴儿一般指1岁以内的儿童，此时其扁桃体尚未发育完善。若发生炎症感染，通常会出现咽部充血表现，炎症刺激咽部时就可能引发时不时咳嗽、干呕症状。可通过检查血常规辅助诊断，若为细菌感染，可使用头孢克洛干悬剂、头孢氨苄颗粒等药物；若为病毒感染，可用利巴韦林、抗病毒口服液等治疗。但由于婴儿年龄小，用药需在医生指导下进行。
二、支气管炎：婴儿有此症状可能与支气管炎有关，可进行胸片检查辅助诊断。当炎症刺激婴儿咽部会厌时会出现干呕现象，明确病因后可采用止咳化痰的治疗方案，可在医生指导下服用小儿咳喘灵颗粒、氨溴索口服液等药物。
三、胃食管反流：婴儿各器官尚未发育完善，胃处于水平位，进食后在咳嗽有压力或体位改变时易导致食物反流，从而引起呛咳和干呕症状。可将婴儿保持竖立位，症状轻微可暂时观察，若病情加重则应尽早就医，可在医生指导下使用西咪替丁等抑酸药以减少胃酸对食管的刺激。
四、气管异物：除上述因素外，该症状也可能与气管异物有关，应进行胸片或气管镜检查，以尽早取出异物。
总之，当婴儿出现时不时咳嗽且伴有干呕时，要考虑多种可能的原因，需仔细观察并根据具体情况进行相应检查和治疗。