羊水粪染主要是胎儿在宫内排出胎便导致的。正常情况下，胎儿在孕中期后肠道会有胎便形成，当胎儿在宫内出现缺氧等情况时，就会刺激肛门括约肌，使胎儿排出胎便，从而导致羊水粪染。据统计，在分娩过程中约有10% - 20%的胎儿会出现不同程度的羊水粪染情况。
胎儿缺氧因素导致
胎盘功能异常：胎盘是胎儿获取营养和氧气的重要器官，如果胎盘出现功能减退，比如胎盘早剥、胎盘老化等情况，会影响胎儿的氧气供应，进而可能引发胎儿排出胎便，造成羊水粪染。胎盘早剥是指妊娠20周后或分娩期，正常位置的胎盘在胎儿娩出前，部分或全部从子宫壁剥离，这会严重影响胎儿的血氧供应。脐带因素：脐带是连接胎儿和胎盘的通道，如果脐带绕颈过紧、脐带扭转、脐带脱垂等，会阻碍胎儿的血液循环，导致胎儿缺氧，引发胎儿排出胎便使羊水粪染。脐带绕颈在孕期比较常见，但如果绕颈过紧影响血供就会有风险，大约有20%的胎儿会出现脐带绕颈情况，其中部分可能会引发后续问题。
胎儿自身因素影响
胎儿肠道发育异常：虽然这种情况相对较少见，但胎儿自身肠道发育存在异常时，也可能导致在宫内就排出胎便，引起羊水粪染。比如先天性巨结肠等肠道发育畸形，会影响肠道正常的蠕动和排便功能。胎龄相关：一般来说，胎龄较大的胎儿相对更易出现羊水粪染情况。因为随着胎龄增加，胎儿肠道内胎便形成量相对较多，在一些刺激因素下更易排出到羊水中。通常胎龄超过40周的胎儿发生羊水粪染的概率相对胎龄较小的胎儿要高一些。
分娩过程中的影响
宫缩过强：在分娩过程中，如果宫缩过强且频率过高，会使胎儿在宫腔内受到较大压力，也可能诱发胎儿排出胎便，导致羊水粪染。正常的宫缩有助于分娩进行，但过强的宫缩就可能成为不利因素，有研究显示约15%的分娩过程中会出现宫缩过强的情况，其中部分会伴随羊水粪染现象。产程延长：产程延长会让胎儿在宫内待的时间相对较长，在这个过程中胎儿可能会因为缺氧等原因排出胎便，引起羊水粪染。产程延长是指整个分娩过程超过了正常的时间范围，初产妇总产程超过24小时，经产妇总产程超过12小时就属于产程延长，这种情况下羊水粪染的发生率会增加。