引起湿疹的根本原因目前尚未完全明确，但一般认为与内部因素和外部因素相互作用有关。内部因素中，遗传是一个重要方面，约 70%的患者有遗传过敏史，比如父母一方有过敏性疾病，子女患湿疹的风险会增加；此外，自身免疫功能异常也可能引发湿疹，当免疫系统失衡时，容易对自身皮肤产生异常免疫反应。
内部因素方面
遗传因素： 研究表明，若父母患有特应性皮炎等过敏性疾病，子女患湿疹的概率比常人高很多。有数据显示，父母一方有过敏史，子女湿疹发生率约为 40%；父母双方都有过敏史，子女湿疹发生率能达到 60%左右。自身免疫异常： 人体免疫系统正常时能抵御外界侵害，但当免疫功能出现紊乱，比如 T 淋巴细胞功能异常，就可能导致皮肤屏障功能受损，引发湿疹。免疫系统错误地将皮肤当作外来侵害物质进行攻击，使得皮肤出现炎症反应，表现为湿疹的各种症状。
外部因素方面
环境因素： 环境中的过敏原是常见诱因，像尘螨、花粉等。尘螨在室内环境中较为常见，若室内尘螨数量较多，长期接触就可能引发湿疹。比如在灰尘较多、通风不良的房间里居住，尘螨滋生，接触后易导致皮肤过敏出现湿疹。还有温度和湿度的变化也会影响，过于干燥或过于潮湿的环境都可能刺激皮肤，引发湿疹。在干燥的季节，皮肤水分流失快，屏障功能减弱，容易受刺激出现湿疹；而潮湿环境利于某些真菌滋生，也可能诱发湿疹。化学物质刺激： 很多日常生活用品含有化学物质，容易刺激皮肤引发湿疹。例如某些肥皂、沐浴露，其成分可能会破坏皮肤的油脂屏障，使皮肤变得敏感，从而引发湿疹。还有一些化妆品中的某些香料、防腐剂等成分，也可能导致皮肤过敏，出现湿疹样表现。另外，接触某些工业化学物质，如橡胶、油漆等，也可能引起接触性湿疹。
皮肤屏障功能异常方面
皮肤屏障受损： 皮肤的屏障功能主要由角质层等结构来维持，当皮肤屏障受损时，外界的刺激物质更容易侵入皮肤，引发炎症反应导致湿疹。比如过度清洁皮肤，频繁使用去角质产品等，会破坏角质层，使皮肤屏障功能下降，增加湿疹发生的风险。婴儿皮肤比较娇嫩，若护理不当，如洗澡过勤、使用刺激性强的洗浴产品，就容易出现皮肤屏障受损，引发婴儿湿疹。