口腔溃疡的治疗药物有多种，像西瓜霜喷剂就比较常用，一般使用后能在一定程度上缓解疼痛、促进愈合，不过具体效果因个体而异。
局部用药类
西瓜霜喷剂：主要成分有西瓜霜、硼砂等，能起到清热解毒、消肿止痛的作用，直接喷于口腔溃疡处，能缓解疼痛，一般使用后几分钟内可能就能感觉到疼痛减轻，有助于促进溃疡面愈合。冰硼散：由冰片、硼砂、朱砂等组成，有清热解毒、消肿止痛的功效，撒于患处，可改善口腔溃疡引起的疼痛等不适，使用后能在局部形成一层保护膜，促进溃疡修复。
促进愈合类
重组人表皮生长因子凝胶：能促进皮肤与黏膜创面组织修复过程中的DNA、RNA和羟脯氨酸的合成，加速创面肉芽组织生成和上皮细胞增殖，从而缩短创面愈合时间。一般每天使用1-2次，涂于患处即可。但要注意，对本品过敏者禁用。康复新液：可以通利血脉，养阴生肌。内服时能用于瘀血阻滞，胃痛出血，胃、十二指肠溃疡；外用时能冲洗创面，促进肉芽组织生长。口腔溃疡时可含漱或用棉球蘸取后敷于患处，一次含漱10-15分钟，一日3-4次。
缓解疼痛类
利多卡因凝胶：属于局部麻醉药，能暂时阻断神经冲动的产生和传导，起到止痛作用。对于疼痛较为剧烈的口腔溃疡患者，可在进食前涂抹少许于溃疡处，能快速缓解疼痛，但不宜长期频繁使用，儿童要慎用。苯佐卡因凝胶：同样是通过暂时麻醉神经末梢来减轻疼痛，涂抹在口腔溃疡表面，能迅速缓解疼痛症状，不过也不建议长时间大面积使用，孕妇和哺乳期女性使用前需咨询医生。