40天的宝宝出现咳嗽且喉咙有痰，可采取日常护理、口服药物、雾化吸入等方式来治疗，以缓解宝宝症状，若症状持续则要及时去正规医院小儿呼吸科就诊。具体如下：
一、日常护理：
1.当40天宝宝有咳嗽、喉咙有痰症状时，家长可将宝宝抱起，轻轻拍打其背部，这样有助于缓解症状。
2.可以给宝宝喂一些温水，能起到稀释痰液的作用，利于痰液排出。
3.在日常生活中要特别注意保暖，防止宝宝受凉。
二、口服药物：
1.40天宝宝呼吸系统发育不完全，免疫力较低，易受病原菌感染引发呼吸系统疾病，如感冒、咽喉炎、支气管炎或肺炎等，从而出现咳嗽、喉咙有痰现象。
2.家长可在医生指导下，给宝宝服用头孢拉定颗粒、连花清瘟颗粒等药物，能起到消炎抗菌以及抗病毒的效果，有助于控制感染症状。
3.同时可遵医嘱配合使用止咳化痰药物进行治疗，如复方鲜竹沥液、盐酸氨溴索口服溶液等，帮助宝宝缓解症状。
三、雾化吸入：
40天宝宝咳嗽、喉咙有痰，也可通过雾化吸入的方式来改善，可促进痰液排出，改善咳嗽、喉咙有痰的情况，例如使用布地奈德吸入气雾剂。
总之，40天宝宝出现这种情况后要根据具体情况选择合适的方法来处理，如果情况持续不缓解，一定要及时就医诊治。