40天宝宝咳嗽有痰，可采取以下措施：
1.多次少量喂奶：如果是母乳喂养，可适当增加喂奶次数；如果是配方奶喂养，可适当将奶液稀释。喂奶后及时拍嗝，有助于痰液排出。
2.保持适宜的环境温度和湿度：室内温度以22~24℃为宜，相对湿度保持在60%左右。可以使用加湿器增加空气湿度，使宝宝呼吸更顺畅。
3.经常翻身拍背：让宝宝侧卧或抱起侧卧，家长五指微曲成半环状，即空心拳，然后轻轻拍打宝宝前胸及侧胸背部，两侧交替进行，拍背力量不宜过大，由上而下，从外向内，依次进行。每侧拍3~5分钟，每天拍2~3次。
4.雾化治疗：如果宝宝咳嗽有痰的症状比较严重，影响到了正常呼吸或睡眠，可以在医生的指导下进行雾化治疗。雾化治疗可以直接作用于呼吸道，缓解咳嗽、咳痰等症状。
5.及时就医：如果宝宝咳嗽有痰的症状持续加重或出现其他异常症状，如发热、呼吸急促、喘息等，应及时就医，以便明确病因，采取相应的治疗措施。
需要注意的是，40天的宝宝年龄较小，身体各器官发育尚未完善，病情变化较快，如果家长自行处理后宝宝的症状没有缓解或出现加重，应及时带宝宝就医，以免延误病情。