脑袋不由自主轻微晃动的原因主要有以下这些：一是特发性震颤，二是颈椎疾病，三是帕金森病，四是癫痫，此外还有其他一些情况也可能导致。
一、特发性震颤：这是一种躯体某部位不自主且有节律的摆动，头部自主摇晃是其表现之一，此外还会有手和前臂的动作性震颤，这种情况往往具有一定遗传性。
二、颈椎疾病：比如寰枢椎病变、颈椎病等颈椎问题可能引起脑袋不由自主轻微晃动。
三、帕金森病：这是常见于中老年人的神经系统退行性疾病，因神经元变性出现功能障碍，会有头不自主摇晃的现象，同时还可能伴有肌肉僵直、难以保持平衡、记忆力衰退等表现。
四、癫痫：它是由多种原因导致的慢性脑部疾病，脑神经元过度放电，致使反复性、发作性和短暂性的中枢神经系统功能丧失，可能出现无症状的头不自主摇晃，此外还可能有两眼发直、凝视前方、昏厥等症状。
除了以上这些，像颅内占位、甲亢等疾病也可能有头不自主摇晃的情况。如果出现脑袋不由自主轻微晃动，一定要请专业医生进行全面系统的检查，切不可私自用药，以免耽误病情。
总结提示：脑袋不由自主晃动可能由多种原因引起，包括特发性震颤、颈椎疾病、帕金森病、癫痫等，还可能有其他疾病因素，需经专业检查确定原因后再进行合理治疗。